北交所作为服务于创新型中小企业的主阵地，其交易制度的安排兼顾市场流动性与中小企业股票的交易特点，为广大投资者提供了多样化的参与路径。其核心交易机制整体延续了以连续竞价为核心的框架，但结合市场需求也设置了大宗交易等特定方式，以满足不同规模投资者的交易需求。
北交所市场主要提供三种路径。第一种也是最常用的方式为竞价交易，这是指买卖双方通过交易系统发布价格和数量，按照价格优先、时间优先的原则进行自动撮合，是日常交易的主要形式。第二种方式是大宗交易，它属于协议交易的一种，主要针对单笔申报数量较大或金额较高的交易，通过场外协商、场内成交的方式完成，减少大额订单对二级市场价格的冲击。第三种方式是协议转让，这主要适用于特定情形下的股份过户，例如非交易过户或满足特定条件的股份转让，是竞价交易和大宗交易之外的有效补充。
北交所的竞价交易规则具有鲜明的特色，促进价格发现并控制风险。在涨跌幅限制方面，为体现中小企业估值特点，北交所对新上市股票首日不设涨跌幅限制，但设有盘中临时停牌机制；自次日起，股票的涨跌幅限制比例设定为前收盘价的30%，波动空间较主板和创业板更为宽泛。在申报规则上，投资者进行竞价交易时，单笔申报数量应当不低于100股，且可以1股为单位递增，这为交易提供了更高的灵活性。为维护交易价格的连续性，北交所在连续竞价阶段对限价申报设置了有效价格范围，即所谓的价格笼子，以防止异常报价对市场造成干扰。
对于不设涨跌幅限制的上市首日，北交所设置了临时停牌机制以平抑市场非理性波动。当盘中成交价格较开盘价首次上涨或下跌达到30%、60%时，会触发临时停牌，每次停牌时间为10分钟。停牌期间投资者可以申报或撤销申报，复牌时则采用集合竞价方式，随后继续当日交易。这一机制有助于在市场情绪过热时给予投资者冷静期，促进理性交易。
